Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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PTPRTO14522 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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PTPRTO14522 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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PTPRTO14522 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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