Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
RDH8Q9NYR8 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.8 ms