Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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PTPRTO14522 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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PTPRTO14522 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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PTPRTO14522 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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PTPRTO14522 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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PTPRTO14522 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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PTPRTO14522 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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PTPRTO14522 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
PTPRTO14522 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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