Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTPN13Q12923 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
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