Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SMAPO00193 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SMAPO00193 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SMAPO00193 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SMAPO00193 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SMAPO00193 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SMAPO00193 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SMAPO00193 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SMAPO00193 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SMAPO00193 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SMAPO00193 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SMAPO00193 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SMAPO00193 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SMAPO00193 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SMAPO00193 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SMAPO00193 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SMAPO00193 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.3 ms