Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
PTPRTO14522 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
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