Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 LINC00458-206ENST00000607494 849 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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PTPRTO14522 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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PTPRTO14522 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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PTPRTO14522 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PTPRTO14522 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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