Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRTO14522 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRTO14522 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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