Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPRTO14522 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPRTO14522 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
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