Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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PTPRTO14522 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRTO14522 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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