Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTPRTO14522 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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