Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRTO14522 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
PTPRTO14522 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
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