Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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PTPRTO14522 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRTO14522 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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