Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRTO14522 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRTO14522 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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