Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VPREB3Q9UKI3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms