Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Irx6Q9ER75 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Irx6Q9ER75 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Irx6Q9ER75 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx6Q9ER75 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx6Q9ER75 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx6Q9ER75 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx6Q9ER75 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx6Q9ER75 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx6Q9ER75 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Irx6Q9ER75 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.8 ms