Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRMT12Q53H54 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRMT12Q53H54 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms