Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Smco4Q9JIS3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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