Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM11

Tgm6, Transglutaminase 6, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm6Q8BM11 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tgm6Q8BM11 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgm6Q8BM11 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgm6Q8BM11 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgm6Q8BM11 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tgm6Q8BM11 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm6Q8BM11 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm6Q8BM11 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm6Q8BM11 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm6Q8BM11 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm6Q8BM11 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm6Q8BM11 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm6Q8BM11 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm6Q8BM11 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm6Q8BM11 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm6Q8BM11 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm6Q8BM11 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm6Q8BM11 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm6Q8BM11 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm6Q8BM11 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tgm6Q8BM11 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 285.7 ms