Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tomm40Q9QYA2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tomm40Q9QYA2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm40Q9QYA2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tomm40Q9QYA2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tomm40Q9QYA2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tomm40Q9QYA2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tomm40Q9QYA2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tomm40Q9QYA2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tomm40Q9QYA2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tomm40Q9QYA2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tomm40Q9QYA2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tomm40Q9QYA2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tomm40Q9QYA2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tomm40Q9QYA2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tomm40Q9QYA2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tomm40Q9QYA2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tomm40Q9QYA2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tomm40Q9QYA2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tomm40Q9QYA2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tomm40Q9QYA2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tomm40Q9QYA2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tomm40Q9QYA2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tomm40Q9QYA2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tomm40Q9QYA2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tomm40Q9QYA2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tomm40Q9QYA2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tomm40Q9QYA2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tomm40Q9QYA2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tomm40Q9QYA2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tomm40Q9QYA2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tomm40Q9QYA2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tomm40Q9QYA2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tomm40Q9QYA2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tomm40Q9QYA2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms