Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cbx8Q9QXV1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cbx8Q9QXV1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cbx8Q9QXV1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cbx8Q9QXV1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cbx8Q9QXV1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cbx8Q9QXV1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cbx8Q9QXV1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cbx8Q9QXV1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cbx8Q9QXV1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cbx8Q9QXV1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cbx8Q9QXV1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cbx8Q9QXV1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cbx8Q9QXV1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cbx8Q9QXV1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cbx8Q9QXV1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cbx8Q9QXV1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cbx8Q9QXV1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cbx8Q9QXV1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cbx8Q9QXV1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cbx8Q9QXV1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cbx8Q9QXV1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cbx8Q9QXV1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cbx8Q9QXV1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cbx8Q9QXV1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cbx8Q9QXV1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cbx8Q9QXV1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cbx8Q9QXV1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cbx8Q9QXV1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cbx8Q9QXV1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cbx8Q9QXV1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cbx8Q9QXV1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cbx8Q9QXV1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cbx8Q9QXV1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cbx8Q9QXV1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cbx8Q9QXV1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cbx8Q9QXV1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cbx8Q9QXV1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cbx8Q9QXV1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cbx8Q9QXV1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cbx8Q9QXV1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cbx8Q9QXV1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cbx8Q9QXV1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cbx8Q9QXV1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cbx8Q9QXV1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cbx8Q9QXV1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cbx8Q9QXV1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cbx8Q9QXV1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cbx8Q9QXV1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cbx8Q9QXV1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cbx8Q9QXV1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cbx8Q9QXV1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cbx8Q9QXV1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cbx8Q9QXV1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cbx8Q9QXV1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cbx8Q9QXV1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cbx8Q9QXV1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cbx8Q9QXV1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cbx8Q9QXV1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cbx8Q9QXV1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cbx8Q9QXV1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cbx8Q9QXV1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cbx8Q9QXV1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cbx8Q9QXV1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cbx8Q9QXV1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cbx8Q9QXV1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cbx8Q9QXV1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cbx8Q9QXV1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cbx8Q9QXV1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cbx8Q9QXV1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cbx8Q9QXV1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cbx8Q9QXV1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cbx8Q9QXV1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cbx8Q9QXV1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cbx8Q9QXV1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cbx8Q9QXV1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cbx8Q9QXV1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cbx8Q9QXV1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cbx8Q9QXV1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cbx8Q9QXV1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cbx8Q9QXV1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cbx8Q9QXV1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cbx8Q9QXV1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cbx8Q9QXV1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cbx8Q9QXV1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cbx8Q9QXV1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cbx8Q9QXV1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cbx8Q9QXV1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cbx8Q9QXV1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cbx8Q9QXV1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cbx8Q9QXV1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cbx8Q9QXV1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cbx8Q9QXV1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cbx8Q9QXV1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cbx8Q9QXV1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cbx8Q9QXV1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cbx8Q9QXV1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cbx8Q9QXV1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cbx8Q9QXV1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cbx8Q9QXV1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 306.9 ms