Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trp53inp1Q9QXE4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trp53inp1Q9QXE4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trp53inp1Q9QXE4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trp53inp1Q9QXE4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trp53inp1Q9QXE4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trp53inp1Q9QXE4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Trp53inp1Q9QXE4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trp53inp1Q9QXE4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trp53inp1Q9QXE4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trp53inp1Q9QXE4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trp53inp1Q9QXE4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trp53inp1Q9QXE4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Trp53inp1Q9QXE4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trp53inp1Q9QXE4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trp53inp1Q9QXE4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trp53inp1Q9QXE4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trp53inp1Q9QXE4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trp53inp1Q9QXE4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trp53inp1Q9QXE4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trp53inp1Q9QXE4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Trp53inp1Q9QXE4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trp53inp1Q9QXE4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trp53inp1Q9QXE4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trp53inp1Q9QXE4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trp53inp1Q9QXE4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trp53inp1Q9QXE4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trp53inp1Q9QXE4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trp53inp1Q9QXE4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trp53inp1Q9QXE4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trp53inp1Q9QXE4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trp53inp1Q9QXE4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trp53inp1Q9QXE4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trp53inp1Q9QXE4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trp53inp1Q9QXE4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trp53inp1Q9QXE4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trp53inp1Q9QXE4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trp53inp1Q9QXE4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trp53inp1Q9QXE4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trp53inp1Q9QXE4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trp53inp1Q9QXE4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trp53inp1Q9QXE4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trp53inp1Q9QXE4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trp53inp1Q9QXE4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trp53inp1Q9QXE4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trp53inp1Q9QXE4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trp53inp1Q9QXE4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trp53inp1Q9QXE4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trp53inp1Q9QXE4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trp53inp1Q9QXE4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trp53inp1Q9QXE4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Trp53inp1Q9QXE4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trp53inp1Q9QXE4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trp53inp1Q9QXE4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trp53inp1Q9QXE4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trp53inp1Q9QXE4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trp53inp1Q9QXE4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trp53inp1Q9QXE4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trp53inp1Q9QXE4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trp53inp1Q9QXE4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trp53inp1Q9QXE4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trp53inp1Q9QXE4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trp53inp1Q9QXE4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trp53inp1Q9QXE4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trp53inp1Q9QXE4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trp53inp1Q9QXE4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trp53inp1Q9QXE4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trp53inp1Q9QXE4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trp53inp1Q9QXE4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trp53inp1Q9QXE4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trp53inp1Q9QXE4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trp53inp1Q9QXE4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trp53inp1Q9QXE4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trp53inp1Q9QXE4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trp53inp1Q9QXE4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trp53inp1Q9QXE4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trp53inp1Q9QXE4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trp53inp1Q9QXE4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trp53inp1Q9QXE4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trp53inp1Q9QXE4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trp53inp1Q9QXE4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trp53inp1Q9QXE4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trp53inp1Q9QXE4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trp53inp1Q9QXE4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trp53inp1Q9QXE4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trp53inp1Q9QXE4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trp53inp1Q9QXE4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trp53inp1Q9QXE4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trp53inp1Q9QXE4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trp53inp1Q9QXE4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trp53inp1Q9QXE4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trp53inp1Q9QXE4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trp53inp1Q9QXE4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 237.3 ms