Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gfra4Q9JJT2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gfra4Q9JJT2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gfra4Q9JJT2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gfra4Q9JJT2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gfra4Q9JJT2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gfra4Q9JJT2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gfra4Q9JJT2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gfra4Q9JJT2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gfra4Q9JJT2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gfra4Q9JJT2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gfra4Q9JJT2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gfra4Q9JJT2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gfra4Q9JJT2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gfra4Q9JJT2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gfra4Q9JJT2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gfra4Q9JJT2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gfra4Q9JJT2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gfra4Q9JJT2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gfra4Q9JJT2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gfra4Q9JJT2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gfra4Q9JJT2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gfra4Q9JJT2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gfra4Q9JJT2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gfra4Q9JJT2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gfra4Q9JJT2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gfra4Q9JJT2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gfra4Q9JJT2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gfra4Q9JJT2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gfra4Q9JJT2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gfra4Q9JJT2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gfra4Q9JJT2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gfra4Q9JJT2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gfra4Q9JJT2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gfra4Q9JJT2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gfra4Q9JJT2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gfra4Q9JJT2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gfra4Q9JJT2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gfra4Q9JJT2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gfra4Q9JJT2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gfra4Q9JJT2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gfra4Q9JJT2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gfra4Q9JJT2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gfra4Q9JJT2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gfra4Q9JJT2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gfra4Q9JJT2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gfra4Q9JJT2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gfra4Q9JJT2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gfra4Q9JJT2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gfra4Q9JJT2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gfra4Q9JJT2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gfra4Q9JJT2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gfra4Q9JJT2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gfra4Q9JJT2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gfra4Q9JJT2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gfra4Q9JJT2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gfra4Q9JJT2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Gfra4Q9JJT2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gfra4Q9JJT2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Gfra4Q9JJT2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gfra4Q9JJT2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gfra4Q9JJT2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gfra4Q9JJT2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gfra4Q9JJT2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gfra4Q9JJT2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gfra4Q9JJT2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gfra4Q9JJT2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gfra4Q9JJT2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gfra4Q9JJT2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gfra4Q9JJT2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gfra4Q9JJT2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gfra4Q9JJT2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms