Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS9

Cwc15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc15Q9JHS9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cwc15Q9JHS9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cwc15Q9JHS9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cwc15Q9JHS9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cwc15Q9JHS9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cwc15Q9JHS9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cwc15Q9JHS9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc15Q9JHS9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc15Q9JHS9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc15Q9JHS9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc15Q9JHS9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cwc15Q9JHS9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cwc15Q9JHS9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cwc15Q9JHS9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cwc15Q9JHS9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cwc15Q9JHS9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cwc15Q9JHS9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Cwc15Q9JHS9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cwc15Q9JHS9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cwc15Q9JHS9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cwc15Q9JHS9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cwc15Q9JHS9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cwc15Q9JHS9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cwc15Q9JHS9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cwc15Q9JHS9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cwc15Q9JHS9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cwc15Q9JHS9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cwc15Q9JHS9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Cwc15Q9JHS9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cwc15Q9JHS9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cwc15Q9JHS9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cwc15Q9JHS9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cwc15Q9JHS9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cwc15Q9JHS9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cwc15Q9JHS9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cwc15Q9JHS9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cwc15Q9JHS9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cwc15Q9JHS9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cwc15Q9JHS9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cwc15Q9JHS9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cwc15Q9JHS9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cwc15Q9JHS9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cwc15Q9JHS9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cwc15Q9JHS9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cwc15Q9JHS9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cwc15Q9JHS9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cwc15Q9JHS9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cwc15Q9JHS9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cwc15Q9JHS9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cwc15Q9JHS9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cwc15Q9JHS9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cwc15Q9JHS9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cwc15Q9JHS9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cwc15Q9JHS9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cwc15Q9JHS9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cwc15Q9JHS9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cwc15Q9JHS9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cwc15Q9JHS9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cwc15Q9JHS9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cwc15Q9JHS9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cwc15Q9JHS9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cwc15Q9JHS9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cwc15Q9JHS9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cwc15Q9JHS9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cwc15Q9JHS9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cwc15Q9JHS9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cwc15Q9JHS9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc15Q9JHS9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc15Q9JHS9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cwc15Q9JHS9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cwc15Q9JHS9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cwc15Q9JHS9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cwc15Q9JHS9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cwc15Q9JHS9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms