Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cmtr1Q9DBC3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cmtr1Q9DBC3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cmtr1Q9DBC3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cmtr1Q9DBC3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cmtr1Q9DBC3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cmtr1Q9DBC3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cmtr1Q9DBC3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cmtr1Q9DBC3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cmtr1Q9DBC3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cmtr1Q9DBC3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cmtr1Q9DBC3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cmtr1Q9DBC3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cmtr1Q9DBC3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cmtr1Q9DBC3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cmtr1Q9DBC3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cmtr1Q9DBC3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cmtr1Q9DBC3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cmtr1Q9DBC3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cmtr1Q9DBC3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cmtr1Q9DBC3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cmtr1Q9DBC3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cmtr1Q9DBC3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cmtr1Q9DBC3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cmtr1Q9DBC3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cmtr1Q9DBC3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cmtr1Q9DBC3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cmtr1Q9DBC3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cmtr1Q9DBC3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cmtr1Q9DBC3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cmtr1Q9DBC3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cmtr1Q9DBC3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cmtr1Q9DBC3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cmtr1Q9DBC3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cmtr1Q9DBC3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cmtr1Q9DBC3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cmtr1Q9DBC3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cmtr1Q9DBC3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cmtr1Q9DBC3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cmtr1Q9DBC3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cmtr1Q9DBC3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cmtr1Q9DBC3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cmtr1Q9DBC3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cmtr1Q9DBC3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cmtr1Q9DBC3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cmtr1Q9DBC3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cmtr1Q9DBC3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cmtr1Q9DBC3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cmtr1Q9DBC3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cmtr1Q9DBC3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cmtr1Q9DBC3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cmtr1Q9DBC3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cmtr1Q9DBC3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cmtr1Q9DBC3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cmtr1Q9DBC3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cmtr1Q9DBC3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cmtr1Q9DBC3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cmtr1Q9DBC3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cmtr1Q9DBC3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cmtr1Q9DBC3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cmtr1Q9DBC3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cmtr1Q9DBC3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cmtr1Q9DBC3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cmtr1Q9DBC3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cmtr1Q9DBC3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cmtr1Q9DBC3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cmtr1Q9DBC3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cmtr1Q9DBC3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cmtr1Q9DBC3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cmtr1Q9DBC3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cmtr1Q9DBC3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cmtr1Q9DBC3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cmtr1Q9DBC3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cmtr1Q9DBC3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cmtr1Q9DBC3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cmtr1Q9DBC3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cmtr1Q9DBC3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cmtr1Q9DBC3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cmtr1Q9DBC3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cmtr1Q9DBC3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cmtr1Q9DBC3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cmtr1Q9DBC3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cmtr1Q9DBC3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cmtr1Q9DBC3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cmtr1Q9DBC3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cmtr1Q9DBC3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cmtr1Q9DBC3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cmtr1Q9DBC3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cmtr1Q9DBC3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cmtr1Q9DBC3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cmtr1Q9DBC3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cmtr1Q9DBC3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cmtr1Q9DBC3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cmtr1Q9DBC3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cmtr1Q9DBC3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cmtr1Q9DBC3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cmtr1Q9DBC3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cmtr1Q9DBC3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cmtr1Q9DBC3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cmtr1Q9DBC3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms