Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930513O06RikQ9D549 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930513O06RikQ9D549 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930513O06RikQ9D549 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930513O06RikQ9D549 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930513O06RikQ9D549 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930513O06RikQ9D549 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930513O06RikQ9D549 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930513O06RikQ9D549 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930513O06RikQ9D549 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930513O06RikQ9D549 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930513O06RikQ9D549 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930513O06RikQ9D549 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930513O06RikQ9D549 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930513O06RikQ9D549 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930513O06RikQ9D549 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930513O06RikQ9D549 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930513O06RikQ9D549 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930513O06RikQ9D549 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930513O06RikQ9D549 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930513O06RikQ9D549 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930513O06RikQ9D549 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930513O06RikQ9D549 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930513O06RikQ9D549 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930513O06RikQ9D549 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930513O06RikQ9D549 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930513O06RikQ9D549 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930513O06RikQ9D549 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930513O06RikQ9D549 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930513O06RikQ9D549 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930513O06RikQ9D549 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930513O06RikQ9D549 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930513O06RikQ9D549 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930513O06RikQ9D549 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930513O06RikQ9D549 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930513O06RikQ9D549 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930513O06RikQ9D549 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930513O06RikQ9D549 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930513O06RikQ9D549 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930513O06RikQ9D549 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930513O06RikQ9D549 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930513O06RikQ9D549 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930513O06RikQ9D549 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930513O06RikQ9D549 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930513O06RikQ9D549 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930513O06RikQ9D549 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930513O06RikQ9D549 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4930513O06RikQ9D549 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930513O06RikQ9D549 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930513O06RikQ9D549 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930513O06RikQ9D549 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930513O06RikQ9D549 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930513O06RikQ9D549 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930513O06RikQ9D549 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930513O06RikQ9D549 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930513O06RikQ9D549 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930513O06RikQ9D549 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930513O06RikQ9D549 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930513O06RikQ9D549 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930513O06RikQ9D549 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930513O06RikQ9D549 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930513O06RikQ9D549 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930513O06RikQ9D549 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930513O06RikQ9D549 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930513O06RikQ9D549 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
4930513O06RikQ9D549 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930513O06RikQ9D549 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930513O06RikQ9D549 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930513O06RikQ9D549 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930513O06RikQ9D549 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930513O06RikQ9D549 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930513O06RikQ9D549 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930513O06RikQ9D549 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms