Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X5

Pacrgl, PACRG-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PacrglQ9D3X5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PacrglQ9D3X5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PacrglQ9D3X5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PacrglQ9D3X5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PacrglQ9D3X5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PacrglQ9D3X5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PacrglQ9D3X5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PacrglQ9D3X5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PacrglQ9D3X5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PacrglQ9D3X5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PacrglQ9D3X5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PacrglQ9D3X5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PacrglQ9D3X5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PacrglQ9D3X5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PacrglQ9D3X5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PacrglQ9D3X5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PacrglQ9D3X5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PacrglQ9D3X5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PacrglQ9D3X5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PacrglQ9D3X5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PacrglQ9D3X5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PacrglQ9D3X5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PacrglQ9D3X5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PacrglQ9D3X5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PacrglQ9D3X5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PacrglQ9D3X5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PacrglQ9D3X5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PacrglQ9D3X5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PacrglQ9D3X5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PacrglQ9D3X5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PacrglQ9D3X5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PacrglQ9D3X5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PacrglQ9D3X5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PacrglQ9D3X5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PacrglQ9D3X5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PacrglQ9D3X5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PacrglQ9D3X5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PacrglQ9D3X5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PacrglQ9D3X5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PacrglQ9D3X5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PacrglQ9D3X5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PacrglQ9D3X5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PacrglQ9D3X5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PacrglQ9D3X5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PacrglQ9D3X5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PacrglQ9D3X5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PacrglQ9D3X5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PacrglQ9D3X5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PacrglQ9D3X5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PacrglQ9D3X5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PacrglQ9D3X5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PacrglQ9D3X5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PacrglQ9D3X5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PacrglQ9D3X5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PacrglQ9D3X5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PacrglQ9D3X5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PacrglQ9D3X5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PacrglQ9D3X5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PacrglQ9D3X5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PacrglQ9D3X5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PacrglQ9D3X5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PacrglQ9D3X5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PacrglQ9D3X5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PacrglQ9D3X5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PacrglQ9D3X5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PacrglQ9D3X5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PacrglQ9D3X5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PacrglQ9D3X5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PacrglQ9D3X5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PacrglQ9D3X5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PacrglQ9D3X5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PacrglQ9D3X5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms