Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmed11Q9D2R4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmed11Q9D2R4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed11Q9D2R4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmed11Q9D2R4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed11Q9D2R4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed11Q9D2R4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed11Q9D2R4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed11Q9D2R4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmed11Q9D2R4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed11Q9D2R4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed11Q9D2R4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmed11Q9D2R4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed11Q9D2R4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed11Q9D2R4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmed11Q9D2R4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed11Q9D2R4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed11Q9D2R4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed11Q9D2R4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed11Q9D2R4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed11Q9D2R4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmed11Q9D2R4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed11Q9D2R4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmed11Q9D2R4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed11Q9D2R4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed11Q9D2R4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmed11Q9D2R4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmed11Q9D2R4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmed11Q9D2R4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmed11Q9D2R4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed11Q9D2R4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed11Q9D2R4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed11Q9D2R4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed11Q9D2R4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed11Q9D2R4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmed11Q9D2R4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmed11Q9D2R4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmed11Q9D2R4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmed11Q9D2R4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmed11Q9D2R4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed11Q9D2R4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed11Q9D2R4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmed11Q9D2R4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed11Q9D2R4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed11Q9D2R4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed11Q9D2R4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed11Q9D2R4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmed11Q9D2R4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmed11Q9D2R4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmed11Q9D2R4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmed11Q9D2R4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmed11Q9D2R4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmed11Q9D2R4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmed11Q9D2R4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed11Q9D2R4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed11Q9D2R4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed11Q9D2R4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmed11Q9D2R4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmed11Q9D2R4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmed11Q9D2R4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmed11Q9D2R4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmed11Q9D2R4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed11Q9D2R4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed11Q9D2R4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed11Q9D2R4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmed11Q9D2R4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmed11Q9D2R4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmed11Q9D2R4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmed11Q9D2R4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmed11Q9D2R4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmed11Q9D2R4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmed11Q9D2R4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmed11Q9D2R4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmed11Q9D2R4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmed11Q9D2R4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmed11Q9D2R4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmed11Q9D2R4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmed11Q9D2R4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmed11Q9D2R4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmed11Q9D2R4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmed11Q9D2R4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmed11Q9D2R4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmed11Q9D2R4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmed11Q9D2R4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmed11Q9D2R4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmed11Q9D2R4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms