Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N7

Chaf1b, Chromatin assembly factor 1 subunit B, mousemouse

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1bQ9D0N7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chaf1bQ9D0N7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chaf1bQ9D0N7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chaf1bQ9D0N7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chaf1bQ9D0N7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chaf1bQ9D0N7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chaf1bQ9D0N7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chaf1bQ9D0N7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chaf1bQ9D0N7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chaf1bQ9D0N7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chaf1bQ9D0N7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chaf1bQ9D0N7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chaf1bQ9D0N7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chaf1bQ9D0N7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chaf1bQ9D0N7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chaf1bQ9D0N7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Chaf1bQ9D0N7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chaf1bQ9D0N7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Chaf1bQ9D0N7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chaf1bQ9D0N7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chaf1bQ9D0N7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chaf1bQ9D0N7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chaf1bQ9D0N7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chaf1bQ9D0N7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Chaf1bQ9D0N7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chaf1bQ9D0N7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chaf1bQ9D0N7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chaf1bQ9D0N7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chaf1bQ9D0N7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chaf1bQ9D0N7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chaf1bQ9D0N7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chaf1bQ9D0N7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chaf1bQ9D0N7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chaf1bQ9D0N7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chaf1bQ9D0N7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chaf1bQ9D0N7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chaf1bQ9D0N7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chaf1bQ9D0N7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chaf1bQ9D0N7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chaf1bQ9D0N7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Chaf1bQ9D0N7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chaf1bQ9D0N7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chaf1bQ9D0N7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chaf1bQ9D0N7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chaf1bQ9D0N7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chaf1bQ9D0N7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chaf1bQ9D0N7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chaf1bQ9D0N7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chaf1bQ9D0N7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chaf1bQ9D0N7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chaf1bQ9D0N7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chaf1bQ9D0N7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Chaf1bQ9D0N7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Chaf1bQ9D0N7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chaf1bQ9D0N7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chaf1bQ9D0N7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chaf1bQ9D0N7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chaf1bQ9D0N7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Chaf1bQ9D0N7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chaf1bQ9D0N7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chaf1bQ9D0N7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chaf1bQ9D0N7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chaf1bQ9D0N7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chaf1bQ9D0N7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chaf1bQ9D0N7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chaf1bQ9D0N7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chaf1bQ9D0N7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chaf1bQ9D0N7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chaf1bQ9D0N7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chaf1bQ9D0N7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chaf1bQ9D0N7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chaf1bQ9D0N7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chaf1bQ9D0N7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chaf1bQ9D0N7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 276 ms