Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nde1Q9CZA6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nde1Q9CZA6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nde1Q9CZA6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nde1Q9CZA6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nde1Q9CZA6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nde1Q9CZA6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nde1Q9CZA6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nde1Q9CZA6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nde1Q9CZA6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nde1Q9CZA6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nde1Q9CZA6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nde1Q9CZA6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nde1Q9CZA6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nde1Q9CZA6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nde1Q9CZA6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nde1Q9CZA6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nde1Q9CZA6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nde1Q9CZA6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nde1Q9CZA6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nde1Q9CZA6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nde1Q9CZA6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nde1Q9CZA6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nde1Q9CZA6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nde1Q9CZA6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nde1Q9CZA6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nde1Q9CZA6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nde1Q9CZA6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nde1Q9CZA6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nde1Q9CZA6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nde1Q9CZA6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nde1Q9CZA6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nde1Q9CZA6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nde1Q9CZA6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nde1Q9CZA6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nde1Q9CZA6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nde1Q9CZA6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nde1Q9CZA6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nde1Q9CZA6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nde1Q9CZA6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nde1Q9CZA6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nde1Q9CZA6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nde1Q9CZA6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nde1Q9CZA6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nde1Q9CZA6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nde1Q9CZA6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nde1Q9CZA6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nde1Q9CZA6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nde1Q9CZA6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nde1Q9CZA6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nde1Q9CZA6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nde1Q9CZA6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nde1Q9CZA6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nde1Q9CZA6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nde1Q9CZA6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nde1Q9CZA6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nde1Q9CZA6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nde1Q9CZA6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nde1Q9CZA6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nde1Q9CZA6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nde1Q9CZA6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nde1Q9CZA6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nde1Q9CZA6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nde1Q9CZA6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms