Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Klhl35Q9CZ49 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klhl35Q9CZ49 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Klhl35Q9CZ49 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klhl35Q9CZ49 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klhl35Q9CZ49 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klhl35Q9CZ49 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Klhl35Q9CZ49 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klhl35Q9CZ49 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Klhl35Q9CZ49 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klhl35Q9CZ49 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Klhl35Q9CZ49 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhl35Q9CZ49 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhl35Q9CZ49 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Klhl35Q9CZ49 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klhl35Q9CZ49 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klhl35Q9CZ49 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Klhl35Q9CZ49 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Klhl35Q9CZ49 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Klhl35Q9CZ49 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klhl35Q9CZ49 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klhl35Q9CZ49 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Klhl35Q9CZ49 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Klhl35Q9CZ49 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klhl35Q9CZ49 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klhl35Q9CZ49 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klhl35Q9CZ49 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klhl35Q9CZ49 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Klhl35Q9CZ49 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Klhl35Q9CZ49 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klhl35Q9CZ49 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klhl35Q9CZ49 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Klhl35Q9CZ49 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klhl35Q9CZ49 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klhl35Q9CZ49 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Klhl35Q9CZ49 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klhl35Q9CZ49 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klhl35Q9CZ49 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Klhl35Q9CZ49 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhl35Q9CZ49 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Klhl35Q9CZ49 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Klhl35Q9CZ49 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Klhl35Q9CZ49 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhl35Q9CZ49 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhl35Q9CZ49 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhl35Q9CZ49 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhl35Q9CZ49 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Klhl35Q9CZ49 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klhl35Q9CZ49 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klhl35Q9CZ49 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klhl35Q9CZ49 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klhl35Q9CZ49 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Klhl35Q9CZ49 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhl35Q9CZ49 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Klhl35Q9CZ49 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhl35Q9CZ49 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Klhl35Q9CZ49 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhl35Q9CZ49 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhl35Q9CZ49 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Klhl35Q9CZ49 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Klhl35Q9CZ49 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Klhl35Q9CZ49 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klhl35Q9CZ49 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klhl35Q9CZ49 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Klhl35Q9CZ49 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Klhl35Q9CZ49 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl35Q9CZ49 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl35Q9CZ49 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl35Q9CZ49 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl35Q9CZ49 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl35Q9CZ49 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Klhl35Q9CZ49 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl35Q9CZ49 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Klhl35Q9CZ49 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl35Q9CZ49 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl35Q9CZ49 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Klhl35Q9CZ49 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhl35Q9CZ49 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhl35Q9CZ49 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Klhl35Q9CZ49 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl35Q9CZ49 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl35Q9CZ49 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl35Q9CZ49 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl35Q9CZ49 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl35Q9CZ49 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Klhl35Q9CZ49 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhl35Q9CZ49 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhl35Q9CZ49 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Klhl35Q9CZ49 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Klhl35Q9CZ49 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Klhl35Q9CZ49 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Klhl35Q9CZ49 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhl35Q9CZ49 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Klhl35Q9CZ49 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhl35Q9CZ49 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhl35Q9CZ49 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhl35Q9CZ49 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhl35Q9CZ49 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhl35Q9CZ49 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Klhl35Q9CZ49 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms