Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS42

Prps2, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prps2Q9CS42 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prps2Q9CS42 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prps2Q9CS42 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prps2Q9CS42 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prps2Q9CS42 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prps2Q9CS42 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prps2Q9CS42 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prps2Q9CS42 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prps2Q9CS42 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prps2Q9CS42 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prps2Q9CS42 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prps2Q9CS42 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prps2Q9CS42 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prps2Q9CS42 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prps2Q9CS42 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prps2Q9CS42 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prps2Q9CS42 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prps2Q9CS42 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prps2Q9CS42 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prps2Q9CS42 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prps2Q9CS42 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prps2Q9CS42 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prps2Q9CS42 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prps2Q9CS42 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prps2Q9CS42 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prps2Q9CS42 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prps2Q9CS42 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prps2Q9CS42 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prps2Q9CS42 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prps2Q9CS42 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prps2Q9CS42 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prps2Q9CS42 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prps2Q9CS42 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prps2Q9CS42 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prps2Q9CS42 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prps2Q9CS42 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prps2Q9CS42 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prps2Q9CS42 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prps2Q9CS42 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prps2Q9CS42 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prps2Q9CS42 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prps2Q9CS42 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prps2Q9CS42 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prps2Q9CS42 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prps2Q9CS42 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prps2Q9CS42 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prps2Q9CS42 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prps2Q9CS42 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prps2Q9CS42 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Prps2Q9CS42 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Prps2Q9CS42 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prps2Q9CS42 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prps2Q9CS42 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Prps2Q9CS42 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prps2Q9CS42 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prps2Q9CS42 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prps2Q9CS42 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prps2Q9CS42 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prps2Q9CS42 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prps2Q9CS42 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prps2Q9CS42 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prps2Q9CS42 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prps2Q9CS42 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prps2Q9CS42 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prps2Q9CS42 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prps2Q9CS42 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prps2Q9CS42 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prps2Q9CS42 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prps2Q9CS42 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prps2Q9CS42 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prps2Q9CS42 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prps2Q9CS42 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prps2Q9CS42 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prps2Q9CS42 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prps2Q9CS42 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prps2Q9CS42 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prps2Q9CS42 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prps2Q9CS42 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prps2Q9CS42 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prps2Q9CS42 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prps2Q9CS42 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prps2Q9CS42 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prps2Q9CS42 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prps2Q9CS42 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prps2Q9CS42 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prps2Q9CS42 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prps2Q9CS42 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prps2Q9CS42 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prps2Q9CS42 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prps2Q9CS42 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prps2Q9CS42 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prps2Q9CS42 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prps2Q9CS42 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prps2Q9CS42 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prps2Q9CS42 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prps2Q9CS42 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prps2Q9CS42 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prps2Q9CS42 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prps2Q9CS42 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prps2Q9CS42 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms