Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SrrtQ99MR6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SrrtQ99MR6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SrrtQ99MR6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SrrtQ99MR6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SrrtQ99MR6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SrrtQ99MR6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SrrtQ99MR6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SrrtQ99MR6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SrrtQ99MR6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SrrtQ99MR6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SrrtQ99MR6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SrrtQ99MR6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SrrtQ99MR6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SrrtQ99MR6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SrrtQ99MR6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SrrtQ99MR6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SrrtQ99MR6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SrrtQ99MR6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SrrtQ99MR6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SrrtQ99MR6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SrrtQ99MR6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SrrtQ99MR6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SrrtQ99MR6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SrrtQ99MR6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SrrtQ99MR6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SrrtQ99MR6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SrrtQ99MR6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SrrtQ99MR6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SrrtQ99MR6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SrrtQ99MR6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SrrtQ99MR6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SrrtQ99MR6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SrrtQ99MR6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SrrtQ99MR6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SrrtQ99MR6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SrrtQ99MR6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SrrtQ99MR6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SrrtQ99MR6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SrrtQ99MR6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SrrtQ99MR6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SrrtQ99MR6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SrrtQ99MR6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SrrtQ99MR6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SrrtQ99MR6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SrrtQ99MR6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SrrtQ99MR6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SrrtQ99MR6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SrrtQ99MR6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SrrtQ99MR6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SrrtQ99MR6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SrrtQ99MR6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SrrtQ99MR6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SrrtQ99MR6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SrrtQ99MR6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SrrtQ99MR6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SrrtQ99MR6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SrrtQ99MR6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SrrtQ99MR6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SrrtQ99MR6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SrrtQ99MR6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SrrtQ99MR6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SrrtQ99MR6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SrrtQ99MR6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SrrtQ99MR6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SrrtQ99MR6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SrrtQ99MR6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SrrtQ99MR6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SrrtQ99MR6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SrrtQ99MR6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SrrtQ99MR6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SrrtQ99MR6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SrrtQ99MR6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SrrtQ99MR6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SrrtQ99MR6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SrrtQ99MR6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SrrtQ99MR6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SrrtQ99MR6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SrrtQ99MR6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SrrtQ99MR6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SrrtQ99MR6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SrrtQ99MR6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SrrtQ99MR6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SrrtQ99MR6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SrrtQ99MR6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SrrtQ99MR6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SrrtQ99MR6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SrrtQ99MR6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SrrtQ99MR6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SrrtQ99MR6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SrrtQ99MR6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SrrtQ99MR6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SrrtQ99MR6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SrrtQ99MR6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SrrtQ99MR6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SrrtQ99MR6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SrrtQ99MR6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SrrtQ99MR6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SrrtQ99MR6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SrrtQ99MR6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms