Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sntg1Q925E1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sntg1Q925E1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sntg1Q925E1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sntg1Q925E1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sntg1Q925E1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sntg1Q925E1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sntg1Q925E1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sntg1Q925E1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sntg1Q925E1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sntg1Q925E1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sntg1Q925E1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sntg1Q925E1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sntg1Q925E1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sntg1Q925E1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sntg1Q925E1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sntg1Q925E1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sntg1Q925E1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sntg1Q925E1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sntg1Q925E1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sntg1Q925E1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sntg1Q925E1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sntg1Q925E1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sntg1Q925E1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sntg1Q925E1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sntg1Q925E1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms