Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx18Q8VDS8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx18Q8VDS8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stx18Q8VDS8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx18Q8VDS8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Stx18Q8VDS8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Stx18Q8VDS8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx18Q8VDS8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx18Q8VDS8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stx18Q8VDS8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx18Q8VDS8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx18Q8VDS8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx18Q8VDS8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx18Q8VDS8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Stx18Q8VDS8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx18Q8VDS8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx18Q8VDS8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx18Q8VDS8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stx18Q8VDS8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx18Q8VDS8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx18Q8VDS8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stx18Q8VDS8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx18Q8VDS8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx18Q8VDS8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx18Q8VDS8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx18Q8VDS8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx18Q8VDS8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Stx18Q8VDS8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx18Q8VDS8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx18Q8VDS8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Stx18Q8VDS8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx18Q8VDS8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stx18Q8VDS8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Stx18Q8VDS8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx18Q8VDS8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx18Q8VDS8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx18Q8VDS8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx18Q8VDS8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx18Q8VDS8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx18Q8VDS8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Stx18Q8VDS8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx18Q8VDS8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx18Q8VDS8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx18Q8VDS8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx18Q8VDS8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Stx18Q8VDS8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx18Q8VDS8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx18Q8VDS8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx18Q8VDS8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx18Q8VDS8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Stx18Q8VDS8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx18Q8VDS8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx18Q8VDS8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx18Q8VDS8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx18Q8VDS8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx18Q8VDS8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx18Q8VDS8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stx18Q8VDS8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx18Q8VDS8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms