Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm8Q8R4D5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trpm8Q8R4D5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpm8Q8R4D5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpm8Q8R4D5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpm8Q8R4D5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpm8Q8R4D5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trpm8Q8R4D5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trpm8Q8R4D5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trpm8Q8R4D5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trpm8Q8R4D5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpm8Q8R4D5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpm8Q8R4D5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpm8Q8R4D5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trpm8Q8R4D5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpm8Q8R4D5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpm8Q8R4D5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpm8Q8R4D5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpm8Q8R4D5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trpm8Q8R4D5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm8Q8R4D5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm8Q8R4D5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trpm8Q8R4D5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm8Q8R4D5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm8Q8R4D5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm8Q8R4D5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm8Q8R4D5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trpm8Q8R4D5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm8Q8R4D5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm8Q8R4D5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm8Q8R4D5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trpm8Q8R4D5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm8Q8R4D5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trpm8Q8R4D5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpm8Q8R4D5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trpm8Q8R4D5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trpm8Q8R4D5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpm8Q8R4D5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trpm8Q8R4D5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm8Q8R4D5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm8Q8R4D5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm8Q8R4D5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trpm8Q8R4D5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpm8Q8R4D5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpm8Q8R4D5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpm8Q8R4D5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpm8Q8R4D5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trpm8Q8R4D5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm8Q8R4D5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm8Q8R4D5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trpm8Q8R4D5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm8Q8R4D5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm8Q8R4D5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm8Q8R4D5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm8Q8R4D5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm8Q8R4D5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trpm8Q8R4D5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm8Q8R4D5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trpm8Q8R4D5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trpm8Q8R4D5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trpm8Q8R4D5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm8Q8R4D5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm8Q8R4D5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trpm8Q8R4D5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm8Q8R4D5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm8Q8R4D5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm8Q8R4D5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trpm8Q8R4D5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm8Q8R4D5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm8Q8R4D5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trpm8Q8R4D5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm8Q8R4D5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm8Q8R4D5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpm8Q8R4D5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms