Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc58Q8R3Q6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc58Q8R3Q6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc58Q8R3Q6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc58Q8R3Q6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc58Q8R3Q6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc58Q8R3Q6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc58Q8R3Q6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc58Q8R3Q6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc58Q8R3Q6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc58Q8R3Q6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc58Q8R3Q6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc58Q8R3Q6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc58Q8R3Q6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc58Q8R3Q6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc58Q8R3Q6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc58Q8R3Q6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc58Q8R3Q6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc58Q8R3Q6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc58Q8R3Q6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc58Q8R3Q6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc58Q8R3Q6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc58Q8R3Q6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc58Q8R3Q6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc58Q8R3Q6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc58Q8R3Q6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc58Q8R3Q6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc58Q8R3Q6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc58Q8R3Q6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc58Q8R3Q6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc58Q8R3Q6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc58Q8R3Q6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc58Q8R3Q6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc58Q8R3Q6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc58Q8R3Q6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc58Q8R3Q6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc58Q8R3Q6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc58Q8R3Q6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc58Q8R3Q6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc58Q8R3Q6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc58Q8R3Q6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc58Q8R3Q6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc58Q8R3Q6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc58Q8R3Q6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc58Q8R3Q6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc58Q8R3Q6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc58Q8R3Q6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc58Q8R3Q6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc58Q8R3Q6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc58Q8R3Q6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc58Q8R3Q6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc58Q8R3Q6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc58Q8R3Q6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc58Q8R3Q6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc58Q8R3Q6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc58Q8R3Q6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc58Q8R3Q6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ccdc58Q8R3Q6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms