Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssh3Q8K330 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssh3Q8K330 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssh3Q8K330 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssh3Q8K330 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssh3Q8K330 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssh3Q8K330 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssh3Q8K330 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssh3Q8K330 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssh3Q8K330 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssh3Q8K330 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssh3Q8K330 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssh3Q8K330 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssh3Q8K330 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssh3Q8K330 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssh3Q8K330 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssh3Q8K330 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssh3Q8K330 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssh3Q8K330 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssh3Q8K330 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssh3Q8K330 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssh3Q8K330 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssh3Q8K330 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssh3Q8K330 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssh3Q8K330 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssh3Q8K330 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssh3Q8K330 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssh3Q8K330 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssh3Q8K330 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssh3Q8K330 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssh3Q8K330 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssh3Q8K330 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssh3Q8K330 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssh3Q8K330 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssh3Q8K330 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssh3Q8K330 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssh3Q8K330 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssh3Q8K330 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssh3Q8K330 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ssh3Q8K330 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssh3Q8K330 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssh3Q8K330 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssh3Q8K330 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssh3Q8K330 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssh3Q8K330 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssh3Q8K330 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssh3Q8K330 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssh3Q8K330 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssh3Q8K330 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssh3Q8K330 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssh3Q8K330 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssh3Q8K330 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssh3Q8K330 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssh3Q8K330 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssh3Q8K330 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ssh3Q8K330 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ssh3Q8K330 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ssh3Q8K330 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ssh3Q8K330 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ssh3Q8K330 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ssh3Q8K330 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ssh3Q8K330 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ssh3Q8K330 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ssh3Q8K330 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ssh3Q8K330 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ssh3Q8K330 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssh3Q8K330 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssh3Q8K330 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssh3Q8K330 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssh3Q8K330 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssh3Q8K330 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssh3Q8K330 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssh3Q8K330 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssh3Q8K330 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssh3Q8K330 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssh3Q8K330 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssh3Q8K330 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssh3Q8K330 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssh3Q8K330 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssh3Q8K330 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssh3Q8K330 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssh3Q8K330 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssh3Q8K330 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssh3Q8K330 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssh3Q8K330 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ssh3Q8K330 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ssh3Q8K330 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ssh3Q8K330 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh3Q8K330 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh3Q8K330 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh3Q8K330 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssh3Q8K330 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssh3Q8K330 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssh3Q8K330 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssh3Q8K330 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssh3Q8K330 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssh3Q8K330 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssh3Q8K330 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssh3Q8K330 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssh3Q8K330 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms