Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc47a1Q8K0H1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc47a1Q8K0H1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc47a1Q8K0H1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc47a1Q8K0H1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc47a1Q8K0H1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc47a1Q8K0H1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc47a1Q8K0H1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc47a1Q8K0H1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc47a1Q8K0H1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc47a1Q8K0H1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc47a1Q8K0H1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc47a1Q8K0H1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc47a1Q8K0H1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc47a1Q8K0H1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc47a1Q8K0H1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc47a1Q8K0H1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc47a1Q8K0H1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc47a1Q8K0H1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc47a1Q8K0H1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc47a1Q8K0H1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc47a1Q8K0H1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc47a1Q8K0H1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc47a1Q8K0H1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc47a1Q8K0H1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc47a1Q8K0H1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc47a1Q8K0H1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc47a1Q8K0H1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc47a1Q8K0H1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc47a1Q8K0H1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc47a1Q8K0H1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc47a1Q8K0H1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc47a1Q8K0H1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc47a1Q8K0H1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc47a1Q8K0H1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc47a1Q8K0H1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc47a1Q8K0H1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc47a1Q8K0H1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc47a1Q8K0H1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc47a1Q8K0H1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc47a1Q8K0H1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc47a1Q8K0H1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc47a1Q8K0H1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc47a1Q8K0H1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc47a1Q8K0H1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc47a1Q8K0H1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc47a1Q8K0H1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc47a1Q8K0H1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc47a1Q8K0H1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc47a1Q8K0H1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc47a1Q8K0H1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc47a1Q8K0H1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc47a1Q8K0H1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc47a1Q8K0H1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc47a1Q8K0H1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc47a1Q8K0H1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc47a1Q8K0H1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc47a1Q8K0H1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc47a1Q8K0H1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc47a1Q8K0H1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc47a1Q8K0H1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc47a1Q8K0H1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc47a1Q8K0H1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc47a1Q8K0H1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc47a1Q8K0H1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc47a1Q8K0H1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc47a1Q8K0H1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc47a1Q8K0H1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc47a1Q8K0H1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc47a1Q8K0H1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc47a1Q8K0H1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc47a1Q8K0H1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc47a1Q8K0H1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc47a1Q8K0H1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc47a1Q8K0H1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc47a1Q8K0H1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc47a1Q8K0H1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc47a1Q8K0H1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc47a1Q8K0H1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc47a1Q8K0H1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc47a1Q8K0H1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc47a1Q8K0H1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc47a1Q8K0H1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc47a1Q8K0H1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc47a1Q8K0H1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc47a1Q8K0H1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc47a1Q8K0H1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc47a1Q8K0H1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc47a1Q8K0H1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc47a1Q8K0H1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc47a1Q8K0H1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc47a1Q8K0H1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc47a1Q8K0H1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc47a1Q8K0H1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc47a1Q8K0H1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc47a1Q8K0H1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc47a1Q8K0H1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc47a1Q8K0H1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc47a1Q8K0H1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc47a1Q8K0H1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms