Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gpc3Q8CFZ4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gpc3Q8CFZ4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gpc3Q8CFZ4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gpc3Q8CFZ4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gpc3Q8CFZ4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gpc3Q8CFZ4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gpc3Q8CFZ4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gpc3Q8CFZ4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gpc3Q8CFZ4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gpc3Q8CFZ4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gpc3Q8CFZ4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gpc3Q8CFZ4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gpc3Q8CFZ4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gpc3Q8CFZ4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gpc3Q8CFZ4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gpc3Q8CFZ4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gpc3Q8CFZ4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gpc3Q8CFZ4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gpc3Q8CFZ4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gpc3Q8CFZ4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gpc3Q8CFZ4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Gpc3Q8CFZ4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gpc3Q8CFZ4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gpc3Q8CFZ4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gpc3Q8CFZ4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gpc3Q8CFZ4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gpc3Q8CFZ4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gpc3Q8CFZ4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gpc3Q8CFZ4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gpc3Q8CFZ4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gpc3Q8CFZ4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gpc3Q8CFZ4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Gpc3Q8CFZ4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gpc3Q8CFZ4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gpc3Q8CFZ4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gpc3Q8CFZ4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gpc3Q8CFZ4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gpc3Q8CFZ4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gpc3Q8CFZ4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gpc3Q8CFZ4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gpc3Q8CFZ4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gpc3Q8CFZ4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gpc3Q8CFZ4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gpc3Q8CFZ4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gpc3Q8CFZ4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gpc3Q8CFZ4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gpc3Q8CFZ4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gpc3Q8CFZ4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gpc3Q8CFZ4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gpc3Q8CFZ4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gpc3Q8CFZ4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gpc3Q8CFZ4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gpc3Q8CFZ4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Gpc3Q8CFZ4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gpc3Q8CFZ4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gpc3Q8CFZ4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gpc3Q8CFZ4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gpc3Q8CFZ4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gpc3Q8CFZ4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gpc3Q8CFZ4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gpc3Q8CFZ4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gpc3Q8CFZ4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gpc3Q8CFZ4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gpc3Q8CFZ4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gpc3Q8CFZ4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gpc3Q8CFZ4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gpc3Q8CFZ4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gpc3Q8CFZ4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gpc3Q8CFZ4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gpc3Q8CFZ4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gpc3Q8CFZ4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gpc3Q8CFZ4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gpc3Q8CFZ4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gpc3Q8CFZ4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gpc3Q8CFZ4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gpc3Q8CFZ4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gpc3Q8CFZ4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gpc3Q8CFZ4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gpc3Q8CFZ4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gpc3Q8CFZ4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gpc3Q8CFZ4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gpc3Q8CFZ4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gpc3Q8CFZ4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gpc3Q8CFZ4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Gpc3Q8CFZ4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gpc3Q8CFZ4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gpc3Q8CFZ4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gpc3Q8CFZ4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpc3Q8CFZ4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpc3Q8CFZ4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gpc3Q8CFZ4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gpc3Q8CFZ4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gpc3Q8CFZ4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Gpc3Q8CFZ4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gpc3Q8CFZ4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gpc3Q8CFZ4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gpc3Q8CFZ4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gpc3Q8CFZ4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gpc3Q8CFZ4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms