Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prpf18Q8BM39 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf18Q8BM39 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf18Q8BM39 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpf18Q8BM39 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf18Q8BM39 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf18Q8BM39 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
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