Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG75

Tmem198, Transmembrane protein 198, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem198Q8BG75 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem198Q8BG75 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem198Q8BG75 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem198Q8BG75 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem198Q8BG75 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem198Q8BG75 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem198Q8BG75 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem198Q8BG75 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem198Q8BG75 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem198Q8BG75 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem198Q8BG75 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem198Q8BG75 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem198Q8BG75 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem198Q8BG75 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem198Q8BG75 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem198Q8BG75 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem198Q8BG75 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem198Q8BG75 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem198Q8BG75 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem198Q8BG75 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem198Q8BG75 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem198Q8BG75 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem198Q8BG75 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem198Q8BG75 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem198Q8BG75 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem198Q8BG75 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem198Q8BG75 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem198Q8BG75 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem198Q8BG75 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem198Q8BG75 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem198Q8BG75 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem198Q8BG75 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem198Q8BG75 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem198Q8BG75 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem198Q8BG75 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem198Q8BG75 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem198Q8BG75 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem198Q8BG75 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem198Q8BG75 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem198Q8BG75 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmem198Q8BG75 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmem198Q8BG75 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem198Q8BG75 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmem198Q8BG75 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem198Q8BG75 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem198Q8BG75 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem198Q8BG75 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem198Q8BG75 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem198Q8BG75 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmem198Q8BG75 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem198Q8BG75 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem198Q8BG75 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem198Q8BG75 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem198Q8BG75 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem198Q8BG75 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem198Q8BG75 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem198Q8BG75 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem198Q8BG75 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem198Q8BG75 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem198Q8BG75 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem198Q8BG75 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmem198Q8BG75 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem198Q8BG75 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem198Q8BG75 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem198Q8BG75 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmem198Q8BG75 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem198Q8BG75 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem198Q8BG75 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem198Q8BG75 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem198Q8BG75 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem198Q8BG75 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem198Q8BG75 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms