Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sh3bgrl2Q8BG73 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sh3bgrl2Q8BG73 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sh3bgrl2Q8BG73 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sh3bgrl2Q8BG73 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bgrl2Q8BG73 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bgrl2Q8BG73 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bgrl2Q8BG73 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bgrl2Q8BG73 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bgrl2Q8BG73 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bgrl2Q8BG73 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 291.2 ms