Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
H2-M10.6Q85ZW5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M10.6Q85ZW5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M10.6Q85ZW5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M10.6Q85ZW5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M10.6Q85ZW5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M10.6Q85ZW5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M10.6Q85ZW5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M10.6Q85ZW5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M10.6Q85ZW5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms