Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NanogQ80Z64 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NanogQ80Z64 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NanogQ80Z64 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NanogQ80Z64 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NanogQ80Z64 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NanogQ80Z64 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NanogQ80Z64 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NanogQ80Z64 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NanogQ80Z64 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NanogQ80Z64 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NanogQ80Z64 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NanogQ80Z64 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NanogQ80Z64 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NanogQ80Z64 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NanogQ80Z64 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NanogQ80Z64 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NanogQ80Z64 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NanogQ80Z64 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NanogQ80Z64 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NanogQ80Z64 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NanogQ80Z64 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NanogQ80Z64 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NanogQ80Z64 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NanogQ80Z64 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NanogQ80Z64 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NanogQ80Z64 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NanogQ80Z64 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NanogQ80Z64 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NanogQ80Z64 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NanogQ80Z64 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NanogQ80Z64 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NanogQ80Z64 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NanogQ80Z64 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NanogQ80Z64 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NanogQ80Z64 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NanogQ80Z64 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NanogQ80Z64 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NanogQ80Z64 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NanogQ80Z64 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NanogQ80Z64 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NanogQ80Z64 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NanogQ80Z64 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NanogQ80Z64 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NanogQ80Z64 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NanogQ80Z64 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NanogQ80Z64 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NanogQ80Z64 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NanogQ80Z64 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NanogQ80Z64 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NanogQ80Z64 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NanogQ80Z64 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NanogQ80Z64 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NanogQ80Z64 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NanogQ80Z64 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NanogQ80Z64 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NanogQ80Z64 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NanogQ80Z64 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NanogQ80Z64 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NanogQ80Z64 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NanogQ80Z64 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NanogQ80Z64 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NanogQ80Z64 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NanogQ80Z64 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NanogQ80Z64 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NanogQ80Z64 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NanogQ80Z64 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
NanogQ80Z64 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NanogQ80Z64 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NanogQ80Z64 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NanogQ80Z64 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NanogQ80Z64 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NanogQ80Z64 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NanogQ80Z64 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NanogQ80Z64 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NanogQ80Z64 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NanogQ80Z64 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NanogQ80Z64 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NanogQ80Z64 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NanogQ80Z64 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NanogQ80Z64 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NanogQ80Z64 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NanogQ80Z64 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NanogQ80Z64 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NanogQ80Z64 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NanogQ80Z64 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NanogQ80Z64 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NanogQ80Z64 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NanogQ80Z64 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NanogQ80Z64 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NanogQ80Z64 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NanogQ80Z64 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NanogQ80Z64 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NanogQ80Z64 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NanogQ80Z64 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NanogQ80Z64 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NanogQ80Z64 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NanogQ80Z64 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NanogQ80Z64 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NanogQ80Z64 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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