Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Kdm5bQ80Y84 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
Kdm5bQ80Y84 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Kdm5bQ80Y84 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Kdm5bQ80Y84 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
Kdm5bQ80Y84 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Kdm5bQ80Y84 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Kdm5bQ80Y84 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Kdm5bQ80Y84 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Kdm5bQ80Y84 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Kdm5bQ80Y84 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Kdm5bQ80Y84 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Kdm5bQ80Y84 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
Kdm5bQ80Y84 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Kdm5bQ80Y84 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Kdm5bQ80Y84 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Kdm5bQ80Y84 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Kdm5bQ80Y84 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Kdm5bQ80Y84 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Kdm5bQ80Y84 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
Kdm5bQ80Y84 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
Kdm5bQ80Y84 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Kdm5bQ80Y84 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Kdm5bQ80Y84 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Kdm5bQ80Y84 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Kdm5bQ80Y84 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Kdm5bQ80Y84 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Kdm5bQ80Y84 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Kdm5bQ80Y84 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Kdm5bQ80Y84 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Kdm5bQ80Y84 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Kdm5bQ80Y84 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
Kdm5bQ80Y84 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Kdm5bQ80Y84 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
Kdm5bQ80Y84 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
Kdm5bQ80Y84 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Kdm5bQ80Y84 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Kdm5bQ80Y84 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Kdm5bQ80Y84 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Kdm5bQ80Y84 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Kdm5bQ80Y84 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Kdm5bQ80Y84 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Kdm5bQ80Y84 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Kdm5bQ80Y84 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Kdm5bQ80Y84 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Kdm5bQ80Y84 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Kdm5bQ80Y84 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Kdm5bQ80Y84 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Kdm5bQ80Y84 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Kdm5bQ80Y84 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Kdm5bQ80Y84 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Kdm5bQ80Y84 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Kdm5bQ80Y84 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
Kdm5bQ80Y84 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Kdm5bQ80Y84 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Kdm5bQ80Y84 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Kdm5bQ80Y84 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Kdm5bQ80Y84 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Kdm5bQ80Y84 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC37■■■■□ 3.51
Kdm5bQ80Y84 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Kdm5bQ80Y84 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
Kdm5bQ80Y84 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Kdm5bQ80Y84 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Kdm5bQ80Y84 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Kdm5bQ80Y84 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Kdm5bQ80Y84 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Kdm5bQ80Y84 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Kdm5bQ80Y84 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Kdm5bQ80Y84 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Kdm5bQ80Y84 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Kdm5bQ80Y84 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Kdm5bQ80Y84 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.5
Kdm5bQ80Y84 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
Kdm5bQ80Y84 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Kdm5bQ80Y84 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Kdm5bQ80Y84 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Kdm5bQ80Y84 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Kdm5bQ80Y84 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Kdm5bQ80Y84 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Kdm5bQ80Y84 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Kdm5bQ80Y84 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Kdm5bQ80Y84 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Kdm5bQ80Y84 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Kdm5bQ80Y84 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Kdm5bQ80Y84 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Kdm5bQ80Y84 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Kdm5bQ80Y84 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Kdm5bQ80Y84 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Kdm5bQ80Y84 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Kdm5bQ80Y84 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Kdm5bQ80Y84 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Kdm5bQ80Y84 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Kdm5bQ80Y84 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Kdm5bQ80Y84 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Kdm5bQ80Y84 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Kdm5bQ80Y84 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Kdm5bQ80Y84 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Kdm5bQ80Y84 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Kdm5bQ80Y84 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Kdm5bQ80Y84 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms