Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdh8Q7TSK3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdh8Q7TSK3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdh8Q7TSK3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdh8Q7TSK3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdh8Q7TSK3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdh8Q7TSK3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdh8Q7TSK3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdh8Q7TSK3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdh8Q7TSK3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdh8Q7TSK3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdh8Q7TSK3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdh8Q7TSK3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdh8Q7TSK3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdh8Q7TSK3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdh8Q7TSK3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdh8Q7TSK3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdh8Q7TSK3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdh8Q7TSK3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdh8Q7TSK3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdh8Q7TSK3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdh8Q7TSK3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdh8Q7TSK3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdh8Q7TSK3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdh8Q7TSK3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdh8Q7TSK3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdh8Q7TSK3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdh8Q7TSK3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdh8Q7TSK3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdh8Q7TSK3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdh8Q7TSK3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdh8Q7TSK3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdh8Q7TSK3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdh8Q7TSK3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdh8Q7TSK3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdh8Q7TSK3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdh8Q7TSK3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdh8Q7TSK3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdh8Q7TSK3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdh8Q7TSK3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdh8Q7TSK3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdh8Q7TSK3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdh8Q7TSK3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdh8Q7TSK3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdh8Q7TSK3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdh8Q7TSK3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdh8Q7TSK3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdh8Q7TSK3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdh8Q7TSK3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdh8Q7TSK3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdh8Q7TSK3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdh8Q7TSK3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdh8Q7TSK3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdh8Q7TSK3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdh8Q7TSK3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdh8Q7TSK3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdh8Q7TSK3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdh8Q7TSK3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdh8Q7TSK3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdh8Q7TSK3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdh8Q7TSK3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdh8Q7TSK3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdh8Q7TSK3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdh8Q7TSK3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdh8Q7TSK3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdh8Q7TSK3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdh8Q7TSK3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdh8Q7TSK3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdh8Q7TSK3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdh8Q7TSK3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdh8Q7TSK3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdh8Q7TSK3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdh8Q7TSK3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdh8Q7TSK3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdh8Q7TSK3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdh8Q7TSK3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdh8Q7TSK3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdh8Q7TSK3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdh8Q7TSK3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdh8Q7TSK3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdh8Q7TSK3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdh8Q7TSK3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdh8Q7TSK3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdh8Q7TSK3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdh8Q7TSK3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdh8Q7TSK3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdh8Q7TSK3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdh8Q7TSK3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdh8Q7TSK3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdh8Q7TSK3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdh8Q7TSK3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdh8Q7TSK3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdh8Q7TSK3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdh8Q7TSK3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdh8Q7TSK3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdh8Q7TSK3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdh8Q7TSK3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdh8Q7TSK3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdh8Q7TSK3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdh8Q7TSK3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms