Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
Pcdh8Q7TSK3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Pcdh8Q7TSK3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Pcdh8Q7TSK3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Pcdh8Q7TSK3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Pcdh8Q7TSK3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pcdh8Q7TSK3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Pcdh8Q7TSK3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Pcdh8Q7TSK3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Pcdh8Q7TSK3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Pcdh8Q7TSK3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Pcdh8Q7TSK3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Pcdh8Q7TSK3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Pcdh8Q7TSK3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Pcdh8Q7TSK3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Pcdh8Q7TSK3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Pcdh8Q7TSK3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Pcdh8Q7TSK3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Pcdh8Q7TSK3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Pcdh8Q7TSK3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Pcdh8Q7TSK3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Pcdh8Q7TSK3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Pcdh8Q7TSK3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pcdh8Q7TSK3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pcdh8Q7TSK3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pcdh8Q7TSK3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Pcdh8Q7TSK3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pcdh8Q7TSK3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pcdh8Q7TSK3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pcdh8Q7TSK3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pcdh8Q7TSK3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pcdh8Q7TSK3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pcdh8Q7TSK3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pcdh8Q7TSK3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Pcdh8Q7TSK3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pcdh8Q7TSK3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pcdh8Q7TSK3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Pcdh8Q7TSK3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcdh8Q7TSK3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcdh8Q7TSK3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pcdh8Q7TSK3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pcdh8Q7TSK3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pcdh8Q7TSK3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Pcdh8Q7TSK3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pcdh8Q7TSK3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pcdh8Q7TSK3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcdh8Q7TSK3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcdh8Q7TSK3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Pcdh8Q7TSK3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pcdh8Q7TSK3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcdh8Q7TSK3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcdh8Q7TSK3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcdh8Q7TSK3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pcdh8Q7TSK3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pcdh8Q7TSK3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Pcdh8Q7TSK3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pcdh8Q7TSK3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pcdh8Q7TSK3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pcdh8Q7TSK3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcdh8Q7TSK3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pcdh8Q7TSK3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pcdh8Q7TSK3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcdh8Q7TSK3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcdh8Q7TSK3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcdh8Q7TSK3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pcdh8Q7TSK3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Pcdh8Q7TSK3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pcdh8Q7TSK3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pcdh8Q7TSK3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pcdh8Q7TSK3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pcdh8Q7TSK3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Pcdh8Q7TSK3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pcdh8Q7TSK3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pcdh8Q7TSK3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pcdh8Q7TSK3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pcdh8Q7TSK3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pcdh8Q7TSK3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pcdh8Q7TSK3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pcdh8Q7TSK3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pcdh8Q7TSK3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pcdh8Q7TSK3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pcdh8Q7TSK3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pcdh8Q7TSK3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pcdh8Q7TSK3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pcdh8Q7TSK3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcdh8Q7TSK3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Pcdh8Q7TSK3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Pcdh8Q7TSK3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcdh8Q7TSK3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcdh8Q7TSK3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pcdh8Q7TSK3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcdh8Q7TSK3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pcdh8Q7TSK3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pcdh8Q7TSK3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pcdh8Q7TSK3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pcdh8Q7TSK3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Pcdh8Q7TSK3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pcdh8Q7TSK3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pcdh8Q7TSK3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pcdh8Q7TSK3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.2 ms