Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIC6

Atp1a3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a3Q6PIC6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp1a3Q6PIC6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp1a3Q6PIC6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atp1a3Q6PIC6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp1a3Q6PIC6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atp1a3Q6PIC6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atp1a3Q6PIC6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Atp1a3Q6PIC6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp1a3Q6PIC6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atp1a3Q6PIC6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp1a3Q6PIC6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp1a3Q6PIC6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp1a3Q6PIC6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atp1a3Q6PIC6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp1a3Q6PIC6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp1a3Q6PIC6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atp1a3Q6PIC6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp1a3Q6PIC6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp1a3Q6PIC6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp1a3Q6PIC6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atp1a3Q6PIC6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp1a3Q6PIC6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp1a3Q6PIC6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp1a3Q6PIC6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atp1a3Q6PIC6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp1a3Q6PIC6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp1a3Q6PIC6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atp1a3Q6PIC6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp1a3Q6PIC6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp1a3Q6PIC6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atp1a3Q6PIC6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp1a3Q6PIC6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp1a3Q6PIC6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atp1a3Q6PIC6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atp1a3Q6PIC6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp1a3Q6PIC6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp1a3Q6PIC6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp1a3Q6PIC6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atp1a3Q6PIC6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp1a3Q6PIC6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp1a3Q6PIC6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp1a3Q6PIC6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp1a3Q6PIC6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp1a3Q6PIC6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atp1a3Q6PIC6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atp1a3Q6PIC6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atp1a3Q6PIC6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Atp1a3Q6PIC6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1a3Q6PIC6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1a3Q6PIC6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1a3Q6PIC6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1a3Q6PIC6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1a3Q6PIC6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atp1a3Q6PIC6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp1a3Q6PIC6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp1a3Q6PIC6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp1a3Q6PIC6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atp1a3Q6PIC6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1a3Q6PIC6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1a3Q6PIC6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1a3Q6PIC6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1a3Q6PIC6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1a3Q6PIC6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atp1a3Q6PIC6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp1a3Q6PIC6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp1a3Q6PIC6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Atp1a3Q6PIC6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp1a3Q6PIC6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atp1a3Q6PIC6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp1a3Q6PIC6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Atp1a3Q6PIC6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Atp1a3Q6PIC6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp1a3Q6PIC6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp1a3Q6PIC6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atp1a3Q6PIC6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp1a3Q6PIC6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp1a3Q6PIC6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp1a3Q6PIC6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp1a3Q6PIC6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Atp1a3Q6PIC6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp1a3Q6PIC6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp1a3Q6PIC6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atp1a3Q6PIC6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp1a3Q6PIC6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Atp1a3Q6PIC6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp1a3Q6PIC6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp1a3Q6PIC6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp1a3Q6PIC6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atp1a3Q6PIC6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp1a3Q6PIC6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp1a3Q6PIC6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atp1a3Q6PIC6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp1a3Q6PIC6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Atp1a3Q6PIC6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp1a3Q6PIC6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp1a3Q6PIC6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp1a3Q6PIC6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp1a3Q6PIC6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Atp1a3Q6PIC6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atp1a3Q6PIC6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms