Protein–RNA interactions for Protein: Q61120

Shc3, SHC-transforming protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc3Q61120 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shc3Q61120 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Shc3Q61120 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Shc3Q61120 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shc3Q61120 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shc3Q61120 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shc3Q61120 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shc3Q61120 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shc3Q61120 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shc3Q61120 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Shc3Q61120 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Shc3Q61120 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Shc3Q61120 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shc3Q61120 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shc3Q61120 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shc3Q61120 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Shc3Q61120 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Shc3Q61120 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Shc3Q61120 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Shc3Q61120 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shc3Q61120 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shc3Q61120 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shc3Q61120 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shc3Q61120 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shc3Q61120 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shc3Q61120 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shc3Q61120 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shc3Q61120 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shc3Q61120 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shc3Q61120 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shc3Q61120 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shc3Q61120 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shc3Q61120 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shc3Q61120 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shc3Q61120 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shc3Q61120 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shc3Q61120 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shc3Q61120 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shc3Q61120 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shc3Q61120 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Shc3Q61120 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Shc3Q61120 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shc3Q61120 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shc3Q61120 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Shc3Q61120 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shc3Q61120 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shc3Q61120 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shc3Q61120 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shc3Q61120 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shc3Q61120 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Shc3Q61120 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shc3Q61120 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Shc3Q61120 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shc3Q61120 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shc3Q61120 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shc3Q61120 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shc3Q61120 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Shc3Q61120 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shc3Q61120 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shc3Q61120 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shc3Q61120 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Shc3Q61120 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shc3Q61120 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shc3Q61120 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shc3Q61120 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Shc3Q61120 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Shc3Q61120 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Shc3Q61120 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Shc3Q61120 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Shc3Q61120 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Shc3Q61120 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Shc3Q61120 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Shc3Q61120 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Shc3Q61120 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shc3Q61120 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shc3Q61120 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Shc3Q61120 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shc3Q61120 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shc3Q61120 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Shc3Q61120 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Shc3Q61120 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shc3Q61120 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shc3Q61120 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shc3Q61120 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Shc3Q61120 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shc3Q61120 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shc3Q61120 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Shc3Q61120 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shc3Q61120 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shc3Q61120 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shc3Q61120 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Shc3Q61120 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shc3Q61120 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Shc3Q61120 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shc3Q61120 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shc3Q61120 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shc3Q61120 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shc3Q61120 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Shc3Q61120 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Shc3Q61120 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms